Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp28Q5I043 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp28Q5I043 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms