Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rtl5Q5DTT4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rtl5Q5DTT4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtl5Q5DTT4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtl5Q5DTT4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms