Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otol1Q4ZJM7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otol1Q4ZJM7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otol1Q4ZJM7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms