Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil2Q3V3V9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Carmil2Q3V3V9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms