Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BC051142Q3V0M8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC051142Q3V0M8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BC051142Q3V0M8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC051142Q3V0M8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms