Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcsd1Q3UZA1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rcsd1Q3UZA1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcsd1Q3UZA1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcsd1Q3UZA1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms