Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnpc3Q3UZ01 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms