Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ankrd13cQ3UX43 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ankrd13cQ3UX43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ankrd13cQ3UX43 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd13cQ3UX43 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd13cQ3UX43 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd13cQ3UX43 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ankrd13cQ3UX43 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd13cQ3UX43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd13cQ3UX43 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms