Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
E330034G19RikQ3UWX6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms