Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn13Q3UW68 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn13Q3UW68 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms