Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc4Q3UP24 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrc4Q3UP24 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms