Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch2Q3UMG5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch2Q3UMG5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms