Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc34Q3UI66 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc34Q3UI66 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms