Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx6-3Q3UHX8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx6-3Q3UHX8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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