Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD2

Gfod1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfod1Q3UHD2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfod1Q3UHD2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfod1Q3UHD2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfod1Q3UHD2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfod1Q3UHD2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfod1Q3UHD2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfod1Q3UHD2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfod1Q3UHD2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfod1Q3UHD2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms