Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem88bQ3TYP4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem88bQ3TYP4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem88bQ3TYP4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms