Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srsf6Q3TWW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Srsf6Q3TWW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms