Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43aQ3TL54 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim43aQ3TL54 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim43aQ3TL54 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms