Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1lQ2KN98 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1lQ2KN98 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1lQ2KN98 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms