Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgfbp3Q1HCM0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgfbp3Q1HCM0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgfbp3Q1HCM0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgfbp3Q1HCM0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgfbp3Q1HCM0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms