Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf3ip1Q149C2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf3ip1Q149C2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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