Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VgfQ0VGU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VgfQ0VGU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VgfQ0VGU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms