Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rundc1Q0VDN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rundc1Q0VDN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rundc1Q0VDN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms