Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cib3Q0P523 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cib3Q0P523 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cib3Q0P523 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms