Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf9Q07105 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms