Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn6Q03958 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn6Q03958 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms