Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx2Q00262 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx2Q00262 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx2Q00262 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx2Q00262 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms