Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VldlrP98156 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VldlrP98156 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VldlrP98156 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VldlrP98156 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VldlrP98156 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VldlrP98156 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VldlrP98156 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VldlrP98156 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms