Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VegfdP97946 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfdP97946 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfdP97946 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VegfdP97946 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfdP97946 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfdP97946 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VegfdP97946 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms