Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc2P97363 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc2P97363 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc2P97363 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc2P97363 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms