Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh8P97291 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh8P97291 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms