Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frat1P70339 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frat1P70339 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frat1P70339 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frat1P70339 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms