Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stra8P70278 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stra8P70278 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Stra8P70278 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stra8P70278 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Stra8P70278 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stra8P70278 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stra8P70278 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stra8P70278 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Stra8P70278 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stra8P70278 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms