Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Barhl1P63157 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Barhl1P63157 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Barhl1P63157 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Barhl1P63157 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Barhl1P63157 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Barhl1P63157 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms