Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnrpfP62307 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrpfP62307 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms