Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpeP62305 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SnrpeP62305 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms