Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copz1P61924 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copz1P61924 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copz1P61924 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copz1P61924 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copz1P61924 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copz1P61924 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copz1P61924 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Copz1P61924 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms