Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CgnP59242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CgnP59242 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CgnP59242 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CgnP59242 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CgnP59242 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CgnP59242 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CgnP59242 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CgnP59242 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CgnP59242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CgnP59242 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CgnP59242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CgnP59242 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CgnP59242 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CgnP59242 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CgnP59242 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CgnP59242 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CgnP59242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CgnP59242 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CgnP59242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CgnP59242 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CgnP59242 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CgnP59242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CgnP59242 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CgnP59242 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CgnP59242 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CgnP59242 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CgnP59242 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CgnP59242 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CgnP59242 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CgnP59242 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CgnP59242 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CgnP59242 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CgnP59242 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CgnP59242 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CgnP59242 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CgnP59242 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CgnP59242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CgnP59242 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CgnP59242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CgnP59242 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CgnP59242 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CgnP59242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CgnP59242 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CgnP59242 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CgnP59242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CgnP59242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CgnP59242 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CgnP59242 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CgnP59242 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CgnP59242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CgnP59242 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CgnP59242 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CgnP59242 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CgnP59242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CgnP59242 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CgnP59242 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CgnP59242 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CgnP59242 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CgnP59242 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CgnP59242 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CgnP59242 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CgnP59242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CgnP59242 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CgnP59242 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CgnP59242 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CgnP59242 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CgnP59242 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CgnP59242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CgnP59242 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CgnP59242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CgnP59242 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CgnP59242 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms