Protein–RNA interactions for Protein: P58006

Sesn1, Sestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sesn1P58006 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sesn1P58006 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sesn1P58006 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sesn1P58006 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms