Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcd5P56812 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms