Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MipP51180 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MipP51180 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MipP51180 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MipP51180 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MipP51180 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MipP51180 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MipP51180 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MipP51180 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms