Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt6aP50446 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt6aP50446 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt6aP50446 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt6aP50446 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt6aP50446 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt6aP50446 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt6aP50446 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt6aP50446 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt6aP50446 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt6aP50446 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt6aP50446 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt6aP50446 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt6aP50446 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt6aP50446 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt6aP50446 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt6aP50446 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt6aP50446 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt6aP50446 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt6aP50446 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt6aP50446 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt6aP50446 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt6aP50446 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt6aP50446 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms