Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epb41P48193 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb41P48193 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb41P48193 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb41P48193 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb41P48193 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epb41P48193 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms