Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn1bP46414 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn1bP46414 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms