Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LifrP42703 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LifrP42703 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LifrP42703 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LifrP42703 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LifrP42703 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LifrP42703 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LifrP42703 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LifrP42703 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LifrP42703 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LifrP42703 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LifrP42703 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LifrP42703 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LifrP42703 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LifrP42703 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LifrP42703 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LifrP42703 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LifrP42703 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LifrP42703 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LifrP42703 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LifrP42703 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LifrP42703 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LifrP42703 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LifrP42703 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LifrP42703 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LifrP42703 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LifrP42703 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LifrP42703 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LifrP42703 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LifrP42703 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LifrP42703 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LifrP42703 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LifrP42703 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LifrP42703 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LifrP42703 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LifrP42703 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LifrP42703 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LifrP42703 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LifrP42703 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LifrP42703 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LifrP42703 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LifrP42703 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LifrP42703 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LifrP42703 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LifrP42703 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LifrP42703 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LifrP42703 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LifrP42703 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LifrP42703 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LifrP42703 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LifrP42703 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LifrP42703 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LifrP42703 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LifrP42703 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LifrP42703 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LifrP42703 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LifrP42703 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LifrP42703 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LifrP42703 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LifrP42703 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LifrP42703 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LifrP42703 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LifrP42703 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LifrP42703 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LifrP42703 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LifrP42703 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LifrP42703 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LifrP42703 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LifrP42703 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.7 ms