Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Folr1P35846 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Folr1P35846 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Folr1P35846 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Folr1P35846 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Folr1P35846 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Folr1P35846 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms