Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SsbP32067 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SsbP32067 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SsbP32067 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SsbP32067 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SsbP32067 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SsbP32067 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SsbP32067 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SsbP32067 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SsbP32067 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SsbP32067 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SsbP32067 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SsbP32067 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SsbP32067 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SsbP32067 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SsbP32067 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SsbP32067 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SsbP32067 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SsbP32067 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SsbP32067 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SsbP32067 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SsbP32067 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SsbP32067 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SsbP32067 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SsbP32067 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SsbP32067 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SsbP32067 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SsbP32067 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SsbP32067 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SsbP32067 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SsbP32067 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SsbP32067 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SsbP32067 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SsbP32067 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SsbP32067 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SsbP32067 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SsbP32067 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SsbP32067 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SsbP32067 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SsbP32067 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SsbP32067 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SsbP32067 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SsbP32067 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SsbP32067 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SsbP32067 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SsbP32067 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SsbP32067 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SsbP32067 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SsbP32067 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SsbP32067 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SsbP32067 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SsbP32067 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SsbP32067 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SsbP32067 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SsbP32067 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SsbP32067 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SsbP32067 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SsbP32067 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SsbP32067 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SsbP32067 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SsbP32067 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SsbP32067 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SsbP32067 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SsbP32067 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SsbP32067 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SsbP32067 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SsbP32067 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SsbP32067 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SsbP32067 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SsbP32067 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms