Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc11P31313 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc11P31313 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms