Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtgfP29268 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtgfP29268 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtgfP29268 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtgfP29268 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtgfP29268 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtgfP29268 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtgfP29268 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtgfP29268 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms