Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprmP28828 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprmP28828 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprmP28828 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprmP28828 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprmP28828 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprmP28828 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtprmP28828 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprmP28828 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprmP28828 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprmP28828 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprmP28828 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprmP28828 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PtprmP28828 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PtprmP28828 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprmP28828 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprmP28828 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprmP28828 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprmP28828 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
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